Analýza obrazu (Daniel Smutek) ¹⁾

⊃ postprocessing²⁾ ⊃ segmentace

• DP z FZS: Teorie k segmentaci obrazu, informace o níže uvedených progra­mech včetně pochopi­telného pracovního postupu segmentace v programu ITK-SNAP.
• Vizualizace a segmentace na virtuálním pitevním stole na TUL.

3D Slicer – velmi komplexní software zaměřený na analýzu (postprocessing: např. segmentace).

• Program je možno nainstalovat (Stable Release) na školní PC se studentským oprávněním.³⁾
• Tutorial Brain tumor segmentation on MRI in 1 minute 🐭 (včetně )
• Průvodce v češtině; Quick start v angličtině.
• Mé poznámky. Další „tutoriály“ jsou na e‑learningu.
• TotalSegmentator – automatická segmentace pomocí AI (doplněk do Sliceru)

Když se ztratíte, znovu zavřete program a znovu ho otevřete.

3D Slicer je náročný na ovládání i výpočetní výkon. Proto můžete zvolit alternativy:

• Homepage – možno nainstalovat (Java), ale radši ne
• použít hned online 👈 názorné – Doporučuji.⁴⁾
  • Vzorové obrázky: File → Open Samples (i radiologické)

🐴 Můžete upravovat běžné obrázky pro bakalářku, i po­užívat obrovské množství metod pro úpravu a analýzu obrazu. Když probíráte metodu zpracování obrazu (samé vzorečky), tak zde si ji můžete prakticky osahat.

• ITK-SNAP – pouze segmentace; nutno nainstalovat. Přímý odkaz na stažení bez vyplňování formuláře; další verze programu.
• – vizuální programo­vání (Pipeline Browser)⁵⁾, ovšem s DICOM mi nefunguje. Online prohlížečka Glance funguje.
• nebo dokonce programovací jazyk R