Kamil Nešetřil

Podklady pro výuku

Uživatelské nástroje

Nástroje pro tento web


Rozdíly

Zde můžete vidět rozdíly mezi vybranou verzí a aktuální verzí dané stránky.

Odkaz na výstup diff

Obě strany předchozí revizePředchozí verze
Následující verze
Předchozí verze
it:ra:image [20.04.2024] – [Dermatologie] Kamil Nešetřilit:ra:image [06.05.2024] (aktuální) Kamil Nešetřil
Řádek 3: Řádek 3:
 [[pdf>https://connect.cuni.cz/p56t0n19qto/|Analýza obrazu]] [[pdf>https://connect.cuni.cz/p56t0n19qto/|Analýza obrazu]]
  
-⊃ postprocessing ⊃ segmentace+⊃ //postprocessing//((//preprocessing// je úprava raw dat)) ⊃ segmentace
   * {{https://dspace.tul.cz/bitstream/handle/15240/153376/DP_Tomas_Soucek.pdf#page=33|DP}} z FZS: Teorie k segmentaci obrazu, informace o níže uvedených progra­mech včetně pochopi­telného pracovního postupu segmentace v programu ITK-SNAP.   * {{https://dspace.tul.cz/bitstream/handle/15240/153376/DP_Tomas_Soucek.pdf#page=33|DP}} z FZS: Teorie k segmentaci obrazu, informace o níže uvedených progra­mech včetně pochopi­telného pracovního postupu segmentace v programu ITK-SNAP.
   * Vizualizace a segmentace na [[youtube>https://www.youtube.com/watch?v=gI2WrppJP_E&t=173| virtuálním pitevním stole]] na TUL.   * Vizualizace a segmentace na [[youtube>https://www.youtube.com/watch?v=gI2WrppJP_E&t=173| virtuálním pitevním stole]] na TUL.
Řádek 11: Řádek 11:
 [[foss>https://www.slicer.org/|3D Slicer]] – velmi komplexní software zaměřený na analýzu (postprocessing: např. segmentace). [[foss>https://www.slicer.org/|3D Slicer]] – velmi komplexní software zaměřený na analýzu (postprocessing: např. segmentace).
   * program je možno nainstalovat na školní PC se studentským oprávněním((//portable// varianta se neosvědčila))   * program je možno nainstalovat na školní PC se studentským oprávněním((//portable// varianta se neosvědčila))
 +  * Tutorial [[youtube>https://www.youtube.com/watch?v=cybL5A0w3hw|Brain tumor segmentation on MRI in 1 minute]]
   * {{vosynek_2019.pdf#page=19|Průvodce}} v češtině.   * {{vosynek_2019.pdf#page=19|Průvodce}} v češtině.
   * [[nesetril>https://docs.google.com/document/d/1448vRSNWmpxR5zyI--KVoYTg-OSQYQJLCM9kpHiN5Ic/edit|Mé poznámky]]. Další „tutoriály“ jsou na e-learningu.   * [[nesetril>https://docs.google.com/document/d/1448vRSNWmpxR5zyI--KVoYTg-OSQYQJLCM9kpHiN5Ic/edit|Mé poznámky]]. Další „tutoriály“ jsou na e-learningu.
   * 🐭 (včetně {{3d-glasses.png?16x16&nolink|Zdroj obrázku: https://www.flaticon.com/free-icon/3d-glasses_742803}})   * 🐭 (včetně {{3d-glasses.png?16x16&nolink|Zdroj obrázku: https://www.flaticon.com/free-icon/3d-glasses_742803}})
  
-==== Alternativy k programu 3D Slicer ====+===== Alternativy k programu 3D Slicer =====
 3D Slicer je náročný na ovládání i výpočetní výkon. Proto můžete zvolit alternativy: 3D Slicer je náročný na ovládání i výpočetní výkon. Proto můžete zvolit alternativy:
   * **[[foss>https://imagej.nih.gov/ij/docs/concepts.html|ImageJ]]** – možno nainstalovat (Java) i použít hned [[tools>https://ij.imjoy.io/|online]] 👈 názorné – Doporučuji.((Přepsaná verze (Fiji) vypadá slibně, ale nefunguje mi. 🐭 samostatná práce: představit a ukázat jednu metodu))   * **[[foss>https://imagej.nih.gov/ij/docs/concepts.html|ImageJ]]** – možno nainstalovat (Java) i použít hned [[tools>https://ij.imjoy.io/|online]] 👈 názorné – Doporučuji.((Přepsaná verze (Fiji) vypadá slibně, ale nefunguje mi. 🐭 samostatná práce: představit a ukázat jednu metodu))
Poslední úprava: 20.04.2024